En ny metod utvecklas nu för att spåra bakteriers dna direkt i patientprover på akuten, i stället för att odlas. Målet på sikt är att korta tiden för diagnos vid allvarliga infektioner.

Med hjälp av metoden som har utvärderats vid Universitetssjukhuset Örebro kan bakterier i blodet upptäckas blodet på några timmar i stället för dagar.

– Vi har visat att det teoretiskt är möjligt att identifiera sjukdomsorsakande bakterier direkt från ett blodprov taget på akutmottagningen. Nu behöver vi fortsätta utveckla metoderna för att göra dem tillräckligt känsliga och tillförlitliga, säger ST-läkaren David Nestor, som nyligen disputerat vid Örebro universitet.

Sköra löper störst risk för sepsis

Varje år drabbas omkring 900 personer i Örebro län av bakterieinfektioner som sprider sig till blodbanan. I värsta fall kan tillståndet utvecklas till sepsis, ett livshotande tillstånd där kroppens reaktion på infektionen leder till organsvikt.

– Vem som helst kan drabbas, men äldre och sköra personer löper större risk att bli allvarligt sjuka, berättar han.

Bakterier i blodet påvisas i dag genom odling. Cirka 40 milliliter blod från patienten placeras i en näringslösning där eventuella bakterier får växa i ett värmeskåp. Metoden fungerar väl, men det kan ta mellan tolv timmar och tre dygn innan bakterier identifieras och deras känslighet för antibiotika kan analyseras.

– Dessutom vet vi att träffsäkerheten påverkas av hur mycket blod som tas och om patienten redan har fått antibiotika, vilket kan hämma bakteriernas tillväxt, säger David Nestor.

Bakteriernas dna visas snabbt

Den nya forskningen bygger i stället på att identifiera bakteriers arvsmassa direkt från cirka 5 milliliter blod. Cellerna i provet bryts ner och allt frisläppt dna analyseras med avancerad sekvensering och databaserade analyser som skiljer ut bakterie-dna från den stora mängden mänskligt dna.

– Målet är att denna analys ska kunna ge svar inom några timmar. Den stora utmaningen är att mängden bakterie-dna ofta är mycket liten jämfört med mängden mänskligt dna. Det gör det tekniskt mycket krävande och mer forskning behövs.

Viktigt steg mot snabbare diagnostik

Tekniken är dyr och experimentell, men kostnaderna för dna-sekvensering har minskat kraftigt de senaste åren. Resultaten pekar på särskilt stor nytta för de svårast sjuka patienterna och för patienter med hög misstanke om infektion där standardmetoder inte kunnat påvisa orsak.

Nästa steg blir att utveckla metoden för stabil påvisning av små mängder bakterie-dna i patientprover.

I studien har prover analyserats från cirka 500 patienter i Region Örebro län som sökt vård med misstanke om bakterier i blodet mellan åren 2014–2016. Utöver den vanliga diagnostiken lämnade patienterna extra blodprover som kunde användas i forskningen.

Avhandling:

Molecular based approaches for detection of bloodstream infections, Örebro universitet.