Поддерживается исполнение только 64-битных приложений. Не поддерживается работа 32-битных приложений и приложений, собранных в режиме безопасных вычислений.

По умолчанию не поддержано исполнение нескольких потоков одновременно - исполнение всех потоков сериализуется. При этом qemu-e2k не пытается подменить информацию о доступном приложению числе ядер - эмулируемое приложение будет видеть столько ядер, сколько доступно хосту. В качестве возможного решения можно ограничить число доступных ядер на уровне хоста (например, с помощью утилиты taskset) или использовать опцию -e2k-opt maxopt,par для включения одновременного исполнения потоков.

Поддержка работы с сигналами:

• Не поддерживается обработка аппаратных исключений (особых ситуаций). Все аппаратные исключения приводят к SIGKILL.
• Не заполняется структура ucontext, передаваемая в расширенный обработчик сигнала (третий аргумент sa_sigaction).
• Не поддерживается вызов обработчика сигнала на дополнительном (альтернативном) стеке.Флаг SA_ONSTACK игнорируется.

Поддерживается работа с GDB только при чтении гостевого состояния. Поддержка модификации гостевого состояния находится в стадии разработки.

Отсутствует поддержка некоторых операций, не используемых в большинстве приложений.

Отсутствует поддержка работы с плагинами.